原标题:大庆校区李春权研讨团队在转录因子范畴取得新打破
我校大庆校区医学信息学系李春权教授的生物信息课题组在转录因子范畴取得重大成果,研讨论文《KnockTF:a comprehensive human gene expression profile database with knockdown/knockout of tranion factors》于2019年10月被Nar杂志(Nucleic Acids Research,SCI影响因子11.147)接纳并已宣布,张建教师作为一起通讯作者,冯陈晨教师为榜首作者。
KnockTF数据库是一个全面的人类转录因子敲降/敲除的基因表达谱数据库。转录因子(Tranion Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起及其重要的效果,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱剖析是取得转录因子靶基因、探究转录因子功用的最重要战略之一。KnockTF供给了很多与转录因子敲降/敲除相关的人类基因表达谱数据集、转录因子及其靶基因的注释信息、转录因子的上游通路信息和下流靶基因的功用注释信息,以及转录因子绑定到靶基因启动子、增强子和超级增强子的具体绑定信息。
KnockTF数据库构建了一个转录因子——差异表达基因网络,便利用户进行网络剖析可视化,协助阐明晰转录因子相关的功用和潜在的生物学效应。上线一个月内,数据库网站点击率已达到1300余次,在转录因子的研讨范畴正在发挥着杰出的效果,为生命科学范畴供给了强壮的转录因子及增强子生物信息资源和剖析战略。
该研讨得到了国家自然科学基金、黑龙江省自然科学基金、博士后基金、校内伍连德基金以及校内科研立异基金等项目的赞助。
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KnockTF:
http:///KnockTF
来历:哈医大新闻网
修改:刘赫
审稿:滕爽
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